Satoru Fujinuma est un dessinateur de mangas de 29 ans qui peine à se faire un nom depuis ses débuts. Mais ce n’était pas la seule chose dans sa vie qui le frustrait… Il possède en effet un pouvoir surnaturel unique : il est contraint d’empêcher des décès et des catastrophes en étant renvoyé dans le passé avant que l’incident ne se produise, et doit ainsi revivre le même moment jusqu’à ce que l’accident soit évité. Un jour, il se retrouve impliqué dans un accident qui le fait passer pour un meurtrier. Désespéré de sauver la victime, il se renvoie dans le passé et se retrouve élève à l'école primaire, un mois avant la disparition de sa camarade de classe Kayo Hinazuki. Satoru se lance alors dans une nouvelle quête : sauver Kayo et élucider le mystère de sa disparition.