Un groupe de 15 lycéens d’élite est réuni dans un lycée très particulier et prestigieux. Obtenir son diplôme dans cet établissement est pratiquement synonyme de réussite dans la vie, mais y parvenir est extrêmement difficile. L’établissement est dirigé par un ours nommé Monokuma, qui leur explique que l’obtention de leur diplôme dépend de la commission d’un meurtre. La seule façon d’obtenir leur diplôme est de tuer l’un de leurs camarades de classe et de s’en tirer à bon compte. Si les autres élèves découvrent l’identité du meurtrier, celui-ci sera le seul à être exécuté. En revanche, s’ils ne parviennent pas à démasquer le meurtrier, seul ce dernier obtiendra son diplôme et les autres seront exterminés. Lequel des 15 survivra au bain de sang qui s’annonce ?